Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа

Новосибирские биологи совместно с иностранными коллегами из Великобритании, Китая, Дании, США и Южной Кореи секвенировали и упорядочили геном самого высокого наземного существа в мире — масайского жирафа, чей вид относится к исчезающим. Результаты исследований были опубликованы в журнале GigaScience.

Ученые из Новосибирского государственного университета (НГУ) и Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН оптимизировали его геном, уложив прочитанные фрагменты последовательно на хромосомы.

Масайский жираф благодаря своим размерам и росту имеет уникальные анатомические и физиологические особенности, которые представляют интерес для ученых из различных областей исследования. Изучение этого генома позволит понять молекулярную основу уникальных адаптивных черт жирафов и поможет облегчить эволюционный анализ других жвачных животных. Сборка подобного генома — это важнейший ресурс, который может помочь сохранить масайского жирафа. Его численность сократилась на 52% за последние годы.

«Сборка генома масайского жирафа представляла собой так называемую кучу рваного текста без начала и конца. В результате четырехлетней работы у нас получилась „книга про жирафа“, где определены последовательности для 20 тысяч генов», — рассказал руководитель научного направления Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН, инженер лаборатории структурной, функциональной и сравнительной геномики факультета естественных наук НГУ доктор биологических наук Александр Графодатский.

Он отметил, что «дальше будут попытки понять, как эти гены работают: например, за счет каких изменений в них сердце жирафа способно гонять кровь на такую высоту, обходясь без инфарктов».

«Кроме того, эти животные — совершенно отдельная группа парнокопытных, и мы выяснили в деталях, чем их геном отличается от геномов коров, оленей и других изученных видов отряда», — пояснил ученый.